RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 DTLQ9NZJ0 730 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 FZD1Q9UP38 647 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 BPTFQ12830 3046 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TTC36A6NLP5 189 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 B4GALT5O43286 388 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 GRID2O43424 1007 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PRKCBP05771 671 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 CXCL9Q07325 125 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.948e-10■■□□□ 12.3
PMS1-222ENST00000639501 AGAP3Q96P47 875 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 WRNIP1Q96S55 665 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 AGAP2Q99490 1192 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 ITGB3P05106 788 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 CD97P48960 835 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 MTX3Q5HYI7 312 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 C12orf29Q8N999 325 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 CERS2Q96G23 380 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 BIRC8Q96P09 236 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PCYT2Q99447 389 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TMEM221A6NGB7 291 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TMEM114B3SHH9 223 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TK2O00142 265 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 TRIM13O60858 407 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 C4orf22Q6V702 233 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 FIBCD1Q8N539 461 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 INIPQ9NRY2 104 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 HESX1Q9UBX0 185 aa20.89■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 A0A096LPK6 155 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 HDAC3O15379 428 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 B4GALT4O60513 344 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TREML2Q5T2D2 321 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NXNQ6DKJ4 435 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RBBP8Q99708 897 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 A0A0A0MRY4 1105 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MDM4O15151 490 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ART3Q13508 389 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CLEC14AQ86T13 490 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RNF149Q8NC42 400 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ISL2Q96A47 359 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SPATA13Q96N96 652 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PARP14Q460N5 1801 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 C9IYK1 514 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PIGNO95427 931 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MLNP12872 115 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ARSAP15289 507 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PSMB4P28070 264 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SDC4P31431 198 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PSMD7P51665 324 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CCR3P51677 355 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NAA20P61599 178 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PMF1Q6P1K2 205 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SLCO4A1Q96BD0 722 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GMLQ99445 158 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CIB1Q99828 191 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.88■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 DPYSL4O14531 572 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GJB1P08034 283 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NAB1Q13506 487 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PTK2BQ14289 1009 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms