RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636093.1

U6.111-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.111-201ENST00000636093 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 GALNSP34059 522 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PTGDSP41222 190 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MTHFRP42898 656 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PHKA1P46020 1223 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF460Q14592 562 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ANO4Q32M45 955 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 RHPN2Q8IUC4 686 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 FAM71DQ8N9W8 422 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KDM1BQ8NB78 822 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 BICD2Q8TD16 824 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SSC4DQ8WTU2 575 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 C2orf48Q96LS8 159 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 TDP1Q9NUW8 608 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ASNSD1Q9NWL6 643 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 C2CD2Q9Y426 696 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 RAI2Q9Y5P3 530 aa-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 EMSYQ7Z589 1322 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SAC3D1A6NKF1 404 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 GAS7O60861 476 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 RAB11FIP3O75154 756 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KDM4BO94953 1096 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 LY6G6DO95868 133 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MBPP02686 304 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 HGFP14210 728 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 AKR1A1P14550 325 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PDCP20941 246 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 LRPAP1P30533 357 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 TLE1Q04724 770 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KIF22Q14807 665 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SLC27A1Q6PCB7 646 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 RNF180Q86T96 592 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 TM9SF4Q92544 642 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 GJA10Q969M2 543 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF583Q96ND8 569 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 LRRC61Q9BV99 259 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SHOC2Q9UQ13 582 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 DNM3Q9UQ16 869 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MMACHCQ9Y4U1 282 aa-0.61□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 FBN2P35556 2912 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 DYTNA2CJ06 578 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF587BE7ETH6 402 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PRYO14603 147 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 TNFRSF6BO95407 300 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 HOXC8P31273 242 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 BMXP51813 675 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 BCAT1P54687 386 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 CDC42EP1Q00587 391 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 CCDC15Q0P6D6 951 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 FUT7Q11130 342 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 NFE2L2Q16236 605 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 DHRS13Q6UX07 377 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 GADL1Q6ZQY3 521 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF280BQ86YH2 543 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ENTHD1Q8IYW4 607 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 STPG4Q8N801 248 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 KAT2AQ92830 837 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 OR1F2PQ96R84 312 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 B3GNT4Q9C0J1 378 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ERVK-5Q9HDB9 667 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 PFDN2Q9UHV9 154 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 USP22Q9UPT9 525 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 NEU3Q9UQ49 428 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 VDAC3Q9Y277 283 aa-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa-0.63□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa-0.63□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 A0A0G2JPF8 293 aa-0.63□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 ASPDHA6ND91 283 aa-0.63□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa-0.63□□□□□ -2.51
U6.111-201ENST00000636093 STMND1H3BQB6 276 aa-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms