RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MED11Q9P086 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SLC28A1O00337 649 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PRRG1O14668 218 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OGTO15294 1046 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FGF19O95750 216 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LRG1P02750 347 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SP8Q8IXZ3 490 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00471Q8N535 108 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SGF29Q96ES7 293 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 BBS4Q96RK4 519 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 WDR24Q96S15 920 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CGRRF1Q99675 332 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 WDCPQ9H6R7 721 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 APBA3O96018 575 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HSMCR30P0CW71 290 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RAB43Q86YS6 212 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MEIOBQ8N635 442 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HPDLQ96IR7 371 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.47□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SCGB2A1O75556 95 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LCP1P13796 627 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CLCN5P51795 746 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 STRADAQ7RTN6 431 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 BCS1LQ9Y276 419 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TULP3O75386 442 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GH2P01242 217 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 BMP7P18075 431 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OMPP47874 163 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SMARCB1Q12824 385 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RNF149Q8NC42 400 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CALML5Q9NZT1 146 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NAGPAQ9UK23 515 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ORC5O43913 435 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 IFNA7P01567 189 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-DRAP01903 254 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ASMTP46597 345 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RFX8Q6ZV50 586 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 C17orf50Q8WW18 174 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TCF12Q99081 682 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MARK1Q9P0L2 795 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.46□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 H3BN98 237 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 NR5A2O00482 541 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 HMBSP08397 361 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 ELP6Q0PNE2 266 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 PKN1Q16512 942 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF280DQ6N043 979 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF276Q8N554 614 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 BTBD9Q96Q07 612 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 NARFQ9UHQ1 456 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 POLIQ9UNA4 740 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 AVILO75366 819 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 TGFB3P10600 412 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 COL6A2P12110 1019 aa6.46□□□□□ -1.38
SCN2A-209ENST00000636071 PRG2P13727 222 aa6.46□□□□□ -1.38
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