RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DPP3Q9NY33 737 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BNIP3LO60238 219 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ARIH2O95376 493 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ATF6P18850 670 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRDX6P30041 224 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BCAP31P51572 246 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC5A3P53794 718 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 POU4F1Q01851 419 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LPCAT4Q643R3 524 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PIK3R3Q92569 461 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TP53INP1Q96A56 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF570Q96NI8 536 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MUC3BQ9H195 1237 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN4O14817 238 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MYL12BO14950 172 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 IL1R1P14778 569 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCNFP41002 786 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CLCN2P51788 898 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MYL6P60660 151 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PSME3P61289 254 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCL15Q16663 113 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KIZQ2M2Z5 673 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM47BQ8NA70 645 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CPNE1Q99829 537 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ITM2BQ9Y287 266 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMX2Q9Y320 296 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C2orf81A6NN90 581 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL18O94889 574 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PTPN7P35236 360 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PKNOX1P55347 436 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRKCQQ04759 706 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GJB7Q6PEY0 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HTRA1Q92743 480 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM143Q96AN5 459 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SIK2Q9H0K1 926 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF222Q9UK12 451 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 UBE2QL1A1L167 161 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ITIH1P19827 911 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FGFR3P22607 806 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TGFBR2P37173 567 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FBXW4P57775 412 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAAP100Q0VG06 881 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HERC3Q15034 1050 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TOMM20Q15388 145 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DCAF6Q58WW2 860 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM139Q8IV31 216 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MYLPFQ96A32 169 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC19Q9H756 370 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RGS18Q9NS28 235 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PHF11Q9UIL8 331 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms