RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 TLL1O43897 1013 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNTN5O94779 1100 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADH1AP07327 375 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRIA1P42261 906 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAPKAPK2P49137 400 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNJLQ8IV13 435 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP36Q96G28 342 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBK1Q9UHD2 729 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 SDR42E2A6NKP2 422 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACNG3O60359 315 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAML1Q92585 1016 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 GORASP1Q9BQQ3 440 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMPR1AP36894 532 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRAK1P51617 712 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMED2Q15363 201 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD11Q693B1 232 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF212Q9UDV6 495 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RWDD3Q9Y3V2 267 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRAK3Q9Y616 596 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 F11P03951 625 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 LILRA6Q6PI73 481 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGI2Q8N0V4 545 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP4X1Q8N118 509 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNTD1Q8N815 330 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SELENOSQ9BQE4 189 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAT9Q9BTE0 207 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHRS4Q9BTZ2 278 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASA4BC9J798 803 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 AP3B1O00203 1094 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASA4O43374 803 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 MSH2P43246 934 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUCY1A3Q02108 690 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARP15Q460N3 678 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRD1Q6QNK2 874 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP33Q8TEY7 942 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAFAH2Q99487 392 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC40Q9H9A6 602 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 STC2O76061 302 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRG1P02750 347 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNAR2P48551 515 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RABGAP1LQ5R372 815 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM150AQ86TG1 271 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSDMBQ8TAX9 411 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 FCRL5Q96RD9 977 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF38Q9H0F5 515 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SENP1Q9P0U3 644 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf78A6NCI8 922 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAMP2O60895 175 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEBLO76041 1014 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA31D3P0C874 917 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTNNB1P35222 781 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC5AQ6ZN44 842 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 DENND1CQ8IV53 801 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPP5Q8N3R9 675 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 HMCESQ96FZ2 354 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCF25Q9BQ70 676 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLOD4Q9HC38 313 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTLL3Q9Y4R7 772 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 OBSL1O75147 1896 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANXA9O76027 345 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYS1Q717R9 158 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPTQ96BT3 561 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL21Q9HBE4 155 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 CASS4Q9NQ75 786 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.352e-6■□□□□ 11.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKCHP24723 683 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1E1P30953 314 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC6A4P31645 630 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 RENBPP51606 427 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPARCL1Q14515 664 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-208ENST00000573600 STEAP4Q687X5 459 aa29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms