RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NCOR1	O75376	2440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288		A8MXQ7	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DVL2	O14641	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HCRT	O43612	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	STX10	O60499	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM13	O60858	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AKAP3	O75969	853 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	OAZ2	O95190	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	P4HA1	P13674	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GJA1	P17302	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CD58	P19256	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PAX3	P23760	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNE1	P24864	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LMO2	P25791	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AOAH	P28039	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MC4R	P32245	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R2	P41236	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNC1	P48547	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MASP1	P48740	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LHX1	P48742	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AP3M2	P53677	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ROR1	Q01973	937 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TWF1	Q12792	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MORC3	Q14149	939 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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