RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DNPH1	O43598	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	LCAT	P04180	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CHRNA5	P30532	468 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HAL	P42357	657 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	RHAG	Q02094	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	IP6K1	Q92551	441 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	EID2B	Q96D98	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MECR	Q9BV79	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ACOT8	O14734	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	RGS14	O43566	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SPRY3	O43610	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ABCB4	P21439	1286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MT3	P25713	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DUSP6	Q16828	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PLK5	Q496M5	336 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MUL1	Q969V5	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MED30	Q96HR3	178 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	BECN2	A8MW95	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ASNA1	O43681	348 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PEPD	P12955	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CPA1	P15085	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	POLE2	P56282	527 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SELENOV	P59797	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	GPS2	Q13227	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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