RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-208ENST00000550358 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 AMHR2Q16671 573 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 KRT73Q86Y46 540 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 MIPP30301 263 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 PSMC3P17980 439 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 CDC16Q13042 620 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 MON1AQ86VX9 555 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ALLCQ8N6M5 410 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf42Q96LP6 360 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TYMPP19971 482 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ADRA1DP25100 572 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 SHC3Q92529 594 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR15P49685 360 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 MUC13Q9H3R2 512 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 WWP2O00308 870 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 NDUFS2O75306 463 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TUSC3Q13454 348 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 LEMD2Q8NC56 503 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.64□□□□□ -1.03
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