RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528987.1

CD59-211, Transcript of CD59 molecule (CD59 blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD59, Length 3,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59-211ENST00000528987 RAB6AP20340 208 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TM4SF1P30408 202 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ZNF81P51508 661 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 BMXP51813 675 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TFAP4Q01664 338 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TNP2Q05952 138 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 RIPK1Q13546 671 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 RCN1Q15293 331 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CAMK4Q16566 473 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 BAK1Q16611 211 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TTC38Q5R3I4 469 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 WDR48Q8TAF3 677 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 PIGBQ92521 554 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 VCPKMTQ9H867 229 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 RCE1Q9Y256 329 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 LRRC37A3O60309 1634 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 PTPRCP08575 1304 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ERLIN2O94905 339 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 FAM157BP0CG42 384 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 EPORP19235 508 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CASTP20810 708 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 DNASE1P24855 282 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ADRA1BP35368 520 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 SOX6P35712 828 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 PBX2P40425 430 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TGFB2P61812 414 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CEBPEQ15744 281 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 GPR162Q16538 588 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 SPATA21Q7Z572 469 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CFHR4Q92496 578 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 ELP4Q96EB1 424 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 GON7Q9BXV9 100 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 FOXQ1Q9C009 403 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 NACA2Q9H009 215 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 MUC13Q9H3R2 512 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 GREM2Q9H772 168 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 STX8Q9UNK0 236 aa5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CD59-211ENST00000528987 TMPRSS2O15393 492 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 FUCA1P04066 466 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 TPH1P17752 444 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 OR1G1P47890 313 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 CDH15P55291 814 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 ANTXR2P58335 489 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 ARHGAP8P85298 464 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 NFIAQ12857 509 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 LMAN2Q12907 356 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 CYP2A13Q16696 494 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 MALT1Q9UDY8 824 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 PALLDQ8WX93 1383 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.65□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 C7orf72A4D263 438 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 AGAP5A6NIR3 686 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 C22orf46C9J442 243 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 ASAP2O43150 1006 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 VPS4BO75351 444 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 AK1P00568 194 aa5.64□□□□□ -1.51
CD59-211ENST00000528987 HMBSP08397 361 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms