RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MATN2O00339 956 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TGM2P21980 687 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 BNIP1Q12981 228 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PDK1Q15118 436 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB6Q15916 424 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFA5Q16718 116 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LILRB2Q8N423 598 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 STK32AQ8WU08 396 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ITPKCQ96DU7 683 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PAFAH2Q99487 392 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF670Q9BS34 389 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HGH1Q9BTY7 390 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 UBP1Q9NZI7 540 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CDH9Q9ULB4 789 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ARID2Q68CP9 1835 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0B4J203 849 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 USP12O75317 370 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KRT37O76014 449 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SUN1O94901 812 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ASMTLO95671 621 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PFKMP08237 780 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IVDP26440 423 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CTGFP29279 349 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GABRB2P47870 512 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CRADDP78560 199 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 VSIG1Q86XK7 387 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GPR152Q8TDT2 470 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PSKH2Q96QS6 385 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 AAASQ9NRG9 546 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SRRDQ9UH36 339 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KLRC2P26717 231 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CCNFP41002 786 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CCL23P55773 120 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HTRA3P83110 453 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC3Q13217 504 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TRNP1Q6NT89 227 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ASIC4Q96FT7 647 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 UROC1Q96N76 676 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 IER2Q9BTL4 223 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CEP44Q9C0F1 390 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0U1RQF3 1178 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf60A6NFR6 353 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NRP1O14786 923 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ13O60928 360 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 WFS1O76024 890 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM63AO94886 807 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 INHAP05111 366 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB6P35237 376 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NR1H3Q13133 447 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FYB2Q5VWT5 728 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC6Q86X45 466 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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