RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TCF4P15884 667 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC20A2Q08357 652 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRNQ16849 979 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PARP15Q460N3 678 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 RETSATQ6NUM9 610 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 RHOT1Q8IXI2 618 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM71BQ8TC56 605 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM245Q9H330 911 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 EBF1Q9UH73 591 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CHD5Q8TDI0 1954 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 K7ESF4 209 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 GOT1P17174 413 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 IL12RB1P42701 662 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 NDST2P52849 883 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH6P55285 790 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ODF2Q5BJF6 829 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 VSIG1Q86XK7 387 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 KCTD6Q8NC69 237 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP13A1Q9HD20 1204 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAI1Q9UI46 699 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ADGRG1Q9Y653 693 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 RCCD1A6NED2 376 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SP9P0CG40 484 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TDGF1P13385 188 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCN6P51797 869 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 DAAM2Q86T65 1068 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PDLIM2Q96JY6 352 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOX2Q99424 681 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF670Q9BS34 389 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 DESI2Q9BSY9 194 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 LACRTQ9GZZ8 138 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZSCAN32Q9NX65 697 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ALG6Q9Y672 507 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF487B1APH4 448 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PSTPIP1O43586 416 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT86O43790 486 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC175P0C221 793 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC2P18074 760 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 COMTP21964 271 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R40P59535 323 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 DPYSQ14117 519 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 IL31Q6EBC2 164 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS33Q8NF86 280 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 NELL1Q92832 810 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SPON2Q9BUD6 331 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CKAP5Q14008 2032 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0D9SEW6 157 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 EPHX1P07099 455 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CNR2P34972 360 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB6P35237 376 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 GJC1P36383 396 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CCZ1BP86790 482 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM92Q6UXU6 159 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 LONP2Q86WA8 852 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TSC1Q92574 1164 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMB7Q99436 277 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf42Q9NWW7 574 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS51Q9UID3 782 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TFR2Q9UP52 801 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PQF6 199 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 ANTXRLA6NF34 631 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 WASP42768 502 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 ARSEP51690 589 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 TCF15Q12870 199 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms