RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 CAMK1GQ96NX5 476 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 AKAP13Q12802 2813 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 A0A1B0GVT2 93 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SNAP91O60641 907 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CLDN11O75508 207 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 IGHV4-34P06331 123 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SPINK2P20155 84 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC8A1P32418 973 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CDH4P55283 916 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 FOXC1Q12948 553 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 PTP4A2Q12974 167 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CDO1Q16878 200 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 USP30Q70CQ3 517 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 PSMB7Q99436 277 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MUC3BQ9H195 1237 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SGK2Q9HBY8 427 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 A0A0D9SEW6 157 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 E9PAM4 449 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SRGAP2O75044 1071 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MT-CO1P00395 513 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 F9P00740 461 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 IL1BP01584 269 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 GALCP54803 685 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SULT2A1Q06520 285 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MTA1Q13330 715 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 Q6ZVU0 165 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 OMDQ99983 421 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 EBF2Q9HAK2 575 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SARDHQ9UL12 918 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-211ENST00000506932 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 DRGXA6NNA5 263 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 K7ERQ8 282 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 TEX33O43247 280 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP9BO43861 1147 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 BNIP3LO60238 219 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SH3BP5O60239 455 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 RHOCP08134 193 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 GLDCP23378 1020 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 DRD3P35462 400 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 NNMTP40261 264 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 OXCT1P55809 520 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 DLG2Q15700 870 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC14Q49A88 953 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ACCSLQ4AC99 568 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 LINGO4Q6UY18 593 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 OR7D4Q8NG98 312 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC32A1Q9H598 525 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 GAREM1Q9H706 876 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 VPS51Q9UID3 782 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SCML1Q9UN30 329 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 WASF3Q9UPY6 502 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 USP24Q9UPU5 2620 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 RNF103O00237 685 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ENDOD1O94919 500 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ADH1BP00325 375 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SRCP12931 536 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 CD27P26842 260 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ADPRHP54922 357 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms