RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 KRT81Q14533 505 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RFX8Q6ZV50 586 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1328Q86T90 577 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TEKT4Q8WW24 435 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PSMB7Q99436 277 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CKAP5Q14008 2032 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RCCD1A6NED2 376 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SNAP91O60641 907 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RAMP2O60895 175 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 KRT83P78385 493 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TCEAL1Q15170 157 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 DPYSL2Q16555 572 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 IL31Q6EBC2 164 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 LONP2Q86WA8 852 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PGBD3Q8N328 593 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MYO19Q96H55 970 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM245Q9H330 911 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 VPS51Q9UID3 782 aa20.29■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 H3BRJ5 948 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CBX4O00257 560 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 AXIN1O15169 862 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 GLDCP23378 1020 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ACVRL1P37023 503 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ARL4AP40617 200 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 VAV2P52735 878 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CDH6P55285 790 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CACUL1Q86Y37 369 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NELL1Q92832 810 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MTG2Q9H4K7 406 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 EML5Q05BV3 1969 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TTC34A8MYJ7 566 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 BUB1O43683 1085 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SPOPO43791 374 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TNNT1P13805 278 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 GABRG2P18507 467 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NDUFV2P19404 249 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 HOXA6P31267 233 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ETFBP38117 255 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NNMTP40261 264 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 LINGO4Q6UY18 593 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RASSF3Q86WH2 238 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CD248Q9HCU0 757 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 DMDP11532 3685 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 WASH4PA8MWX3 477 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 KRT7P08729 469 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CD48P09326 243 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ERCC2P18074 760 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 NHLH1Q02575 133 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 DPYSQ14117 519 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ACCSLQ4AC99 568 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 KDM1BQ8NB78 822 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CALN1Q9BXU9 219 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 MAGEH1Q9H213 219 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms