RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GAB3	Q8WWW8	586 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ALG14	Q96F25	216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM245	Q9H330	911 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CD248	Q9HCU0	757 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CD93	Q9NPY3	652 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TFR2	Q9UP52	801 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	FRYL	O94915	3013 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PROB1	E7EW31	1015 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CBX4	O00257	560 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MAP3K13	O43283	966 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DAPK3	O43293	454 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GFRA3	O60609	400 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SIN3B	O75182	1162 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MT-CO1	P00395	513 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	VAV1	P15498	845 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	BCKDHB	P21953	392 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	IL1R2	P27930	398 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CDC25B	P30305	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CNR2	P34972	360 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PCK1	P35558	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ACVRL1	P37023	503 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MRE11	P49959	708 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KRT83	P78385	493 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GNA12	Q03113	381 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SULT2A1	Q06520	285 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SPA17	Q15506	151 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KBTBD6	Q86V97	674 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	OR2T3	Q8NH03	318 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MYO19	Q96H55	970 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PSMB7	Q99436	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SUN2	Q9UH99	717 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	VPS51	Q9UID3	782 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024		K7ERQ8	282 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RAMP2	O60895	175 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PROSC	O94903	275 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RARA	P10276	462 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ACADM	P11310	421 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TNNT1	P13805	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GOT1	P17174	413 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	P2RY2	P41231	377 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MAPKAPK2	P49137	400 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	COPA	P53621	1224 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ACAP1	Q15027	740 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DLG2	Q15700	870 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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