RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 MATKP42679 507 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SCNN1GP51170 649 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ITGA8P53708 1063 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SLC8A3P57103 927 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SCAPQ12770 1279 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 XRCC4Q13426 336 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FXNQ16595 210 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 DENND2CQ68D51 928 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SPRED2Q7Z698 418 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PCGF5Q86SE9 256 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PQLC3Q8N755 202 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ACTL9Q8TC94 416 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 IRGQQ8WZA9 623 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 NTAN1Q96AB6 310 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 NPY6RQ99463 290 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ADAM2Q99965 735 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SYT15Q9BQS2 421 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PPCSQ9HAB8 311 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RRN3Q9NYV6 651 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FETUBQ9UGM5 382 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PQY0 241 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ARVCFO00192 962 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 DNM1LO00429 736 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RGS13O14921 159 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 MCF2LO15068 1137 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ALOX15BO15296 676 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 HCRTO43612 131 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CST8O60676 142 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FKTNO75072 461 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 UBOX5O94941 541 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 WNT11O96014 354 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 AGTP01019 485 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 C8AP07357 584 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CD48P09326 243 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 PDGFRBP09619 1106 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 FAM200BP0CF97 657 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ADORA2BP29275 332 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 L1CAMP32004 1257 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ADCY8P40145 1251 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 HCAR3P49019 387 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 NR2C2P49116 596 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RGS7P49802 495 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CLCNKBP51801 687 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CDH6P55285 790 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 DAOAP59103 153 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SEMA3BQ13214 749 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SNX1Q13596 522 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SLC29A2Q14542 456 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 TAF5Q15542 800 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ODF2Q5BJF6 829 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 C4orf22Q6V702 233 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4A-208ENST00000489247 TDRPQ86YL5 185 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms