RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 ZWILCHQ9H900 591 aa17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PCDH18Q9HCL0 1135 aa17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 EBF1Q9UH73 591 aa17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 TFR2Q9UP52 801 aa17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 HS3ST2Q9Y278 367 aa17■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PSTPIP1O43586 416 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ZMPSTE24O75844 475 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 GOT1P17174 413 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 IL4RP24394 825 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ECT2LQ008S8 904 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 GNA12Q03113 381 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PDK2Q15119 407 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 DESI2Q9BSY9 194 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CIPCQ9C0C6 399 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC19Q9H756 370 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.99■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 A0A0D9SEW6 157 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 H3BRJ5 948 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 DCLK1O15075 740 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CREB3O43889 395 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 NDST2P52849 883 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 DPYSL3Q14195 570 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PARP15Q460N3 678 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CHPFQ8IZ52 775 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 FBRSQ9HAH7 460 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 VPS51Q9UID3 782 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ALG6Q9Y672 507 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.98■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ATP9BO43861 1147 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 RAMP2O60895 175 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 LILRB5O75023 590 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 APBB3O95704 486 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SP9P0CG40 484 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 HOXB2P14652 356 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ERCC2P18074 760 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 COL9A1P20849 921 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 COMTP21964 271 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PRKCHP24723 683 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ARL4AP40617 200 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CLCN6P51797 869 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PTPN5P54829 565 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 KIF5AQ12840 1032 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 TAZQ16635 292 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA1328Q86T90 577 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 LZTR1Q8N653 840 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 FRS2Q8WU20 508 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 MUC3BQ9H195 1237 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 VPS28Q9UK41 221 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.97■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 NRDCO43847 1150 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 NRLP54845 237 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 CDH6P55285 790 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ARF5P84085 180 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SLC20A2Q08357 652 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SDE2Q6IQ49 451 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 OR7D4Q8NG98 312 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 HSPH1Q92598 858 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 DNAI1Q9UI46 699 aa16.96■□□□□ 0.31
HCLS1-208ENST00000487290 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms