RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD6Q8NC69 237 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TEKT4Q8WW24 435 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT35Q92764 455 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DNASE1L2Q92874 299 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CD101Q93033 1021 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RUBCNLQ9H714 662 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MARK1Q9P0L2 795 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 AMFRQ9UKV5 643 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CA14Q9ULX7 337 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf42Q9H799 3197 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DRGXA6NNA5 263 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM24O15164 1050 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT1P04264 644 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT7P08729 469 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CD48P09326 243 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GOT1P17174 413 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KDELR1P24390 212 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CTNNA2P26232 953 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GJA4P35212 333 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 OPRD1P41143 372 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DNA2P51530 1060 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ARSEP51690 589 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH6P55285 790 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TPI1P60174 286 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZXDAP98168 799 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PFKPQ01813 784 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA3BQ13214 749 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf22Q49AR2 442 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MANEALQ5VSG8 457 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC38Q5VT99 294 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RAPGEF5Q92565 580 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CHFRQ96EP1 664 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NEU3Q9UQ49 428 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRD1A4D1F6 860 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KRBA1A5PL33 1030 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 H0Y626 953 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BRJ5 948 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DAPK3O43293 454 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PSTPIP1O43586 416 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNG3O60359 315 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TULP3O75386 442 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CISD3P0C7P0 127 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CD72P21854 359 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 AMPD1P23109 780 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 IL4RP24394 825 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 EPHB2P29323 1055 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NUMBP49757 651 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX5P50542 639 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GALK1P51570 392 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KDSRQ06136 332 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MESP2Q0VG99 397 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DPYSL3Q14195 570 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PDK2Q15119 407 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PON2Q15165 354 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LLGL1Q15334 1064 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DPYSL2Q16555 572 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HS1BP3Q53T59 392 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ODF2Q5BJF6 829 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FSCBQ5H9T9 825 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RFX8Q6ZV50 586 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms