RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NNMTP40261 264 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 COLEC12Q5KU26 742 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM145Q8NBT3 493 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 IFI44Q8TCB0 444 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PAGE5Q96GU1 130 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 COL12A1Q99715 3063 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CALN1Q9BXU9 219 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FAM117AQ9C073 453 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 LTFP02788 710 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ALPPL2P10696 532 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PRLRP16471 622 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R38P59533 333 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ENPEPQ07075 957 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PMF1Q6P1K2 205 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 LGI2Q8N0V4 545 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL13Q8NEE6 735 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 OR13H1Q8NG92 308 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NOX5Q96PH1 765 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FZD3Q9NPG1 666 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 BSNQ9UPA5 3926 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 K7ESM1 405 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 O00370 1275 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 EFSO43281 561 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NEBLO76041 1014 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FYNP06241 537 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SETSIPP0DME0 302 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2H1P32780 548 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NFKB2Q00653 900 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CLN3Q13286 438 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NFIL3Q16649 462 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00303Q3SY05 128 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 RESP18Q5W5W9 173 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 RAP1GAP2Q684P5 730 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 OR8D1Q8WZ84 308 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 IRGQQ8WZA9 623 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A13Q96H72 371 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TJP2Q9UDY2 1190 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1HQ9ULR3 514 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.87■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CDRT15L2A8MXV6 281 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TERTO14746 1132 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SCAMP1O15126 338 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 VDRP11473 427 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PDGFRAP16234 1089 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MXI1P50539 228 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN2P57739 230 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ARL13BQ3SXY8 428 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FOXR1Q6PIV2 292 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PREBQ9HCU5 417 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQU0 124 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ARRDC3Q96B67 414 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 USP29Q9HBJ7 922 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TLR6Q9Y2C9 796 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 KIF26BQ2KJY2 2108 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NEMP2A6NFY4 417 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TACR2P21452 398 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM9Q13443 819 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CUL2Q13617 745 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SLC12A1Q13621 1099 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CDKN3Q16667 212 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ACCSLQ4AC99 568 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 GUSBP11Q6P575 273 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CRTC1Q6UUV9 634 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 GCNT7Q6ZNI0 430 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CHSY1Q86X52 802 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TFAP2BQ92481 460 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms