RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GVM2 712 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPIPA2E9PIF3 369 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H0Y9J4 135 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEMP1O14524 444 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOX12O15370 315 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STRNO43815 780 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUAK1O60285 661 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HBP1O60381 514 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS6KA4O75676 772 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCEA3O75764 348 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM16O95361 564 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1QBP02746 253 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRGV3P03979 118 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNGP13051 313 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPN2P17706 415 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPORP19235 508 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD72P21854 359 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFV1P49821 464 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EMP2P54851 167 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZP1P60852 638 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPARAQ07869 468 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf72Q14CZ0 275 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEAD2Q15562 447 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPN14Q15678 1187 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DPY19L1Q2PZI1 675 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EDRF1Q3B7T1 1238 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF618Q5T7W0 954 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM219BQ5XKK7 198 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KAZNQ674X7 775 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCD3Q6STE5 483 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRROSQ86YC3 692 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CREG2Q8IUH2 290 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM185AQ8N0U4 392 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00528Q8N1L1 170 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC44A3Q8N4M1 653 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF169Q8NCN4 708 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPCN2Q8NHX9 752 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PBXIP1Q96AQ6 731 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHOVQ96L33 236 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZIM3Q96PE6 472 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBBP8Q99708 897 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD60Q9BZ19 345 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUAK2Q9H093 628 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHAC1Q9H158 963 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLEKHA1Q9HB21 404 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEC31BQ9NQW1 1179 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASSF1Q9NS23 344 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGSF9Q9P2J2 1179 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPN11Q9UMQ6 739 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF652Q9Y2D9 606 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CKAP5Q14008 2032 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RREB1Q92766 1687 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRABD2BA6NFA1 517 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM221A6NGB7 291 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR31O00270 319 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VILLO15195 856 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC7A4O43246 635 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF21O75509 655 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHL2O95198 593 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOX14O95416 240 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LGI1O95970 557 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLUD1P00367 558 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM27P14373 513 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP3CCP48454 512 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLUD2P49448 558 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRIM2P49643 509 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P2RY4P51582 365 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EMP3P54852 163 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERVFC1-1P60608 527 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBXN1Q04323 297 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOLH1Q04609 750 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOA4Q13772 614 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LPIN1Q14693 890 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGFBP7Q16270 282 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNA10Q16322 511 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POM121L1PQ3SYA9 428 aa-3.39□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms