RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CDH19Q9H159 772 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SIX4Q9UIU6 781 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RNF103O00237 685 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHA8P1O95397 391 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINA3P01011 423 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CALCAP01258 141 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 APOC2P02655 101 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FECHP22830 423 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-201ENST00000355233 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-201ENST00000355233 KLHL18O94889 574 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-201ENST00000355233 NEK3P51956 506 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CACNB3P54284 484 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-201ENST00000355233 CAMK1Q14012 370 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-201ENST00000355233 FANCFQ9NPI8 374 aa5□□□□□ -1.61
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