RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333090.4

TSKU-201, Transcript of tsukushi, small leucine rich proteoglycan, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSKU, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKU-201ENST00000333090 PTPN9P43378 593 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 NXNQ6DKJ4 435 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 CNDP1Q96KN2 507 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 MARK4Q96L34 752 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 CATSPER2Q96P56 530 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 HES2Q9Y543 173 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 HDAC3O15379 428 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 MAGEA12P43365 314 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 TREML2Q5T2D2 321 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 CHST13Q8NET6 341 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 GPR20Q99678 358 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 WDR41Q9HAD4 459 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 BCAP29Q9UHQ4 241 aa24.1■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 C2P06681 752 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 LCP1P13796 627 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 IGBP1P78318 339 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 DCAF15Q66K64 600 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 C19orf81C9J6K1 198 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 DPP6P42658 865 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ZNF567Q8N184 647 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 URGCPQ8TCY9 931 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 RHBDL2Q9NX52 303 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 USP3Q9Y6I4 520 aa24.09■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 MCF2P10911 925 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ME2P23368 584 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ART3Q13508 389 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 PDK1Q15118 436 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 ISL2Q96A47 359 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.08■■□□□ 1.45
TSKU-201ENST00000333090 A0A1B0GTW7 788 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TK2O00142 265 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TNFAIP2Q03169 654 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PPP2R5DQ14738 602 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 KLC3Q6P597 504 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PID1Q7Z2X4 250 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PGAM4Q8N0Y7 254 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 H3BSA7 217 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PIGNO95427 931 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TGFB3P10600 412 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 CDK4P11802 303 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SCNN1BP51168 640 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 APOFQ13790 326 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 CYTH1Q15438 398 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 CEP70Q8NHQ1 597 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 OXSMQ9NWU1 459 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 EVPLQ92817 2033 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 KCNK1O00180 336 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SAT1P21673 171 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SLC5A2P31639 672 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ITGA7Q13683 1181 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 CLEC14AQ86T13 490 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TTC39CQ8N584 583 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 DDI1Q8WTU0 396 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 KIF12Q96FN5 646 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.07■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 A0A087WZ62 844 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 MPOP05164 745 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SETSIPP0DME0 302 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 TFEBP19484 476 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 GRIA4P48058 902 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 HSPA13P48723 471 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 PGGT1BP53609 377 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 NR1H2P55055 460 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SNX16P57768 344 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 NRF1Q16656 503 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ZNF410Q86VK4 478 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 FAM210AQ96ND0 272 aa24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TSKU-201ENST00000333090 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms