RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 F8VP50 259 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG6O75602 509 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT7P08729 469 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 MED10Q9BTT4 135 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 VCXQ9H320 206 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCP10LQ8TDR4 215 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTH2Q99418 400 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM121Q9BTD3 319 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF11O14901 512 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS4L1P0CG22 281 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS12Q6ZW61 710 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDK16Q00536 496 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 CPT1BQ92523 772 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.96■■□□□ 1.91
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