RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx12Q9ER00 274 aa16.37■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prl2a1Q9JHK0 228 aa16.37■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpxm1Q9Z100 722 aa16.37■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10720D3Z1I5 223 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AvilO88398 819 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klc2O88448 599 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcb1bP06795 1276 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alas2P08680 587 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam167bP17257 162 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msx3P70354 204 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ext2P70428 718 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem26Q3UP23 366 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gata6Q61169 589 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GapdhsQ64467 440 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arl5cQ6P068 179 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnma2Q8BHK0 365 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ThtpaQ8JZL3 224 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nsl1Q8K305 281 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam32Q8K410 754 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnni1Q9WUZ5 187 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap4s1Q9WVL1 144 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arid3bQ9Z1N7 568 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc4a11A2AJN7 862 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mroh5E9PUJ8 762 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grip2G3XA20 1042 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wnt3aP27467 352 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SnnP61807 88 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ThraP63058 492 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mpp1P70290 466 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IhhP97812 411 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oas1fQ14AZ4 364 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Etaa1Q5SVT3 877 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pqlc1Q80XM9 271 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas1r3Q925D8 858 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc45aQ99KD5 944 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MutyhQ99P21 515 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ProzQ9CQW3 399 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspan3Q9QY33 253 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lama3Q61789 3330 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbno2Q7TNB8 1349 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r84D3YWE3 849 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10719E9Q7T3 227 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd3gP11942 182 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igfbp4P47879 254 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmtc3Q8BRH0 920 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr20Q8BYC4 358 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prpf39Q8K2Z2 665 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syap1Q9D5V6 365 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ampd2Q9DBT5 798 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrotQ9DC50 612 aa16.36■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r44L7N2E1 861 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AlbP07724 608 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il6stQ00560 917 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp217Q3U0X6 1041 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Armcx5Q3UZB0 606 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcdQ5EE38 416 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sel1l3Q80TS8 1137 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Afap1l1Q8BZI0 768 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sik2Q8CFH6 931 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creld1Q91XD7 420 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krcc1Q99JT5 256 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nuf2Q99P69 463 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo16Q9QZM9 334 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan12Q9Z1D7 501 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd2P08920 344 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fscn2Q32M02 492 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprrQ62132 656 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r125Q7M710 311 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr299Q7TS05 330 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr139Q80UC8 345 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grik4Q8BMF5 956 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fra10ac1Q8BP78 315 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SgczQ8BX51 311 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atg14Q8CDJ3 492 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim14Q91VT8 99 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcaf2Q921K8 919 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcp2Q9CYC6 422 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Batf3Q9D275 118 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Paqr5Q9DCU0 330 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galntl6E5D8G1 601 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd12bG3UZN6 359 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnk2O54967 1055 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sypl2O89104 264 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AladP10518 330 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q5XFZ0 217 aa16.35■□□□□ 0.21
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgre1Q61549 931 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms