RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751		M0R3G1	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GHR	P10912	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RPIA	P49247	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CENPA	P49450	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PTEN	P60484	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PSMC6	P62333	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	COASY	Q13057	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MTFR1	Q15390	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SNX19	Q92543	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PFDN5	Q99471	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	INPPL1	O15357	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	B4GALT4	O60513	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CLEC3B	P05452	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PCNA	P12004	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	AKAP5	P24588	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PMS2	P54278	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NEDD8	Q15843	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NFIB	O00712	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PEX1	O43933	1283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RGS4	P49798	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CEBPG	P53567	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TTC4	O95801	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CPA3	P15088	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KLRC1	P26715	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GRIK1	P39086	918 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PTH1R	Q03431	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CYTH1	Q15438	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SPAG7	O75391	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RASGRP1	O95267	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	F2	P00734	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CKB	P12277	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SLC9A1	P19634	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HOXA9	P31269	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GRM5	P41594	1212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RHAG	Q02094	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MCL1	Q07820	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms