RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RTN2	O75298	545 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CD38	P28907	300 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ATRX	P46100	2492 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PPP2CB	P62714	309 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PPP2CA	P67775	309 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ACAP1	Q15027	740 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RNF34	Q969K3	372 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PR77	199 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078		F5H5T6	163 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ENC1	O14682	589 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	C7	P10643	843 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	JUP	P14923	745 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GOT1	P17174	413 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ACADSB	P45954	432 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	IRAK1	P51617	712 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ADPRH	P54922	357 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GCNT1	Q02742	428 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CENPC	Q03188	943 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	KLK6	Q92876	244 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SARDH	Q9UL12	918 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MYLK	Q15746	1914 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PMM2	O15305	246 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SDC3	O75056	442 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SLC9A1	P19634	815 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	C5AR1	P21730	350 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GNA15	P30679	374 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	DRD3	P35462	400 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	NNMT	P40261	264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	NME3	Q13232	169 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MYOC	Q99972	504 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	BECN2	A8MW95	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TLR4	O00206	839 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	P4HA2	O15460	535 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MED7	O43513	233 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	DFNA5	O60443	496 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ADH1B	P00325	375 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF18	P17022	549 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ITPKB	P27987	946 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CCR5	P51681	352 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SEMG2	Q02383	582 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MORC3	Q14149	939 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MED15	Q96RN5	788 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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