RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 NACA2Q9H009 215 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RNF38Q9H0F5 515 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GMIPQ9P107 970 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 APOC2P02655 101 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PDGFRAP16234 1089 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 STAT4Q14765 748 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 HECTD3Q5T447 861 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TRNP1Q6NT89 227 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ARCQ7LC44 396 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ACTL9Q8TC94 416 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TEKT4Q8WW24 435 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TTC25Q96NG3 672 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 19.3
SGMS1-210ENST00000619438 FOXQ1Q9C009 403 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OBSL1O75147 1896 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SMAPO00193 183 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 MAN2B1O00754 1011 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA4P43358 317 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SLC6A3Q01959 620 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GPS1Q13098 491 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PMF1Q6P1K2 205 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 NELL2Q99435 816 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PRRX2Q99811 253 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A3Q01955 1670 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM92AA1XBS5 289 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM170BA6NMN3 283 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 HHLA1C9JL84 531 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 E7EVH7 732 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TNK2Q07912 1038 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 BOLA3Q53S33 107 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PEBP4Q96S96 227 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TBCBQ99426 244 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC77Q9BR77 488 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SCML2Q9UQR0 700 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF487B1APH4 448 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SGK1O00141 431 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ARNTLO00327 626 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CD48P09326 243 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GLULP15104 373 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SEC24CP53992 1094 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 BCAT1P54687 386 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TFDP2Q14188 446 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PDK2Q15119 407 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC14Q49A88 953 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PIGZQ86VD9 579 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PJA1Q8NG27 643 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM3CQ92520 227 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CPQQ9Y646 472 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.14■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 C5orf60A6NFR6 353 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SMIM23A6NLE4 172 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NCAM2O15394 837 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PRPSAP2O60256 369 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DESP17661 470 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SLC7A9P82251 487 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PDE4CQ08493 712 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 LONRF1Q17RB8 773 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RFX6Q8HWS3 928 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms