RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 KDM1BQ8NB78 822 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SAP25Q8TEE9 199 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 NELFBQ8WX92 580 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SARDHQ9UL12 918 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FZD4Q9ULV1 537 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.77□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BIN1O00499 593 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ENC1O14682 589 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CAPN9O14815 690 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 P4HA2O15460 535 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RTN2O75298 545 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MOCS3O95396 460 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 IL1BP01584 269 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 APOEP02649 317 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ITGAVP06756 1048 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GOT1P17174 413 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ABCB4P21439 1286 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CCR5P51681 352 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CENPCQ03188 943 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 STIM1Q13586 685 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FRS2Q8WU20 508 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SERAC1Q96JX3 654 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TIGD1Q96MW7 591 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 COX16Q9P0S2 106 aa14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 THAP12O43422 761 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 DFNA5O60443 496 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ADH1BP00325 375 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 C5AR1P21730 350 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GGCXP38435 758 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ACADSBP45954 432 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 NXPH1P58417 271 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TMEM110Q86TL2 294 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ALG14Q96F25 216 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.75□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BECN2A8MW95 431 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 F5H5T6 163 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TLR4O00206 839 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 LATO43561 262 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GRAP2O75791 330 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ITPKBP27987 946 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ACADVLP49748 655 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 NUCB2P80303 420 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CETN1Q12798 172 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MORC3Q14149 939 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 INAVAQ3KP66 663 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FBXL22Q6P050 247 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BEND5Q7L4P6 421 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 DEFB106AQ8N104 65 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 STK32AQ8WU08 396 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 THAP9Q9H5L6 903 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GDF3Q9NR23 364 aa14.74□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms