RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC42	Q96M95	316 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	EPC1	Q9H2F5	836 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	LRCH4	O75427	683 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ALDH1A2	O94788	518 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TCF4	P15884	667 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC12A1	Q13621	1099 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CA9	Q16790	459 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	FRMD1	Q8N878	549 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PSMB7	Q99436	277 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		24.86	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PIEZO1	Q92508	2521 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0D9SEW6	157 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PRR23A	A6NEV1	266 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	MOCS3	O95396	460 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	EPHX1	P07099	455 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NDUFV2	P19404	249 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	L1CAM	P32004	1257 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SEMA3B	Q13214	749 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	EFHC2	Q5JST6	749 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	H2AFV	Q71UI9	128 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NLRP14	Q86W24	1093 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	GAB3	Q8WWW8	586 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RLN3	Q8WXF3	142 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	24.85	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ASL	P04424	464 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RHOC	P08134	193 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR1E1	P30953	314 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CNR2	P34972	360 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OXCT1	P55809	520 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ECT2L	Q008S8	904 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	LPAL2	Q16609	132 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PGBD3	Q8N328	593 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR7D4	Q8NG98	312 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		24.84	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CKAP5	Q14008	2032 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TTC34	A8MYJ7	566 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SNAP91	O60641	907 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF8	O76064	485 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RHOQ	P17081	205 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	IL1R2	P27930	398 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	MRE11	P49959	708 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	COPA	P53621	1224 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	AIF1	P55008	147 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	STARD3	Q14849	445 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	MUC3B	Q9H195	1237 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CD93	Q9NPY3	652 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TPCN1-222	ENST00000552897	USP34	Q70CQ2	3546 aa		24.83	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		24.83	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	CREB3	O43889	395 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM253	P0C7T8	217 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	DES	P17661	470 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	BCKDHB	P21953	392 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	GLDC	P23378	1020 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	E2F5	Q15329	346 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	KBTBD6	Q86V97	674 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	VPS28	Q9UK41	221 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	USP18	Q9UMW8	372 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ILVBL	A1L0T0	632 aa		24.81	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PCK1	P35558	622 aa		24.81	■■□□□ 1.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56

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