RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ADPRHP54922 357 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 STIM1Q13586 685 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ISM2Q6H9L7 571 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 ACADSBP45954 432 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 STK19P49842 368 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 NXPH1P58417 271 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 BNIP3Q12983 259 aa17.55■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 F5H5T6 163 aa17.54■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 RPL34P49207 117 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ACADVLP49748 655 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 GCNT1Q02742 428 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 BEND5Q7L4P6 421 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SPATA20Q8TB22 786 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 C10orf142B7Z368 130 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 KRT5P13647 590 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 VAV1P15498 845 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 PDGFRAP16234 1089 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 PPP2CBP62714 309 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 PPP2CAP67775 309 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SEMG2Q02383 582 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SULT2A1Q06520 285 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 SLC12A1Q13621 1099 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 HES3Q5TGS1 186 aa17.53■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.53■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 LATO43561 262 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ITPKBP27987 946 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 RXRGP48443 463 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 ACCSLQ4AC99 568 aa17.52■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 MFSD2AQ8NA29 543 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 STK32AQ8WU08 396 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 TSC1Q92574 1164 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 RNF34Q969K3 372 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-214ENST00000548849 KREMEN1Q96MU8 473 aa17.52■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 MED15Q96RN5 788 aa17.52■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa17.52■□□□□ 0.4
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CS-214ENST00000548849 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa17.51■□□□□ 0.39
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CS-214ENST00000548849 E5RJQ4 531 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 MED7O43513 233 aa17.51■□□□□ 0.39
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CS-214ENST00000548849 METAP1P53582 386 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 KCNH2Q12809 1159 aa17.51■□□□□ 0.39
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CS-214ENST00000548849 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 FBXL19Q6PCT2 694 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-214ENST00000548849 DSG4Q86SJ6 1040 aa17.51■□□□□ 0.39
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