RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDB1-223	ENST00000543658	NEU3	Q9UQ49	428 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDB1-223	ENST00000543658	RAD54B	Q9Y620	910 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDB1-223	ENST00000543658		H7C0C1	242 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GFRA2	O00451	464 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	KRIT1	O00522	736 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	FANCG	O15287	622 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NCAM2	O15394	837 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CACNG3	O60359	315 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NEBL	O76041	1014 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ASGR2	P07307	311 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ATP5O	P48047	213 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NR2C2	P49116	596 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	DGKG	P49619	791 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ZP2	Q05996	745 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TNK2	Q07912	1038 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TDG	Q13569	410 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PDK1	Q15118	436 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PARP15	Q460N3	678 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PLD5	Q8N7P1	536 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NAT16	Q8N8M0	369 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TTC8	Q8TAM2	541 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SP110	Q9HB58	689 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	VPS28	Q9UK41	221 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ILVBL	A1L0T0	632 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	RASA4B	C9J798	803 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	RASA4	O43374	803 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SRF	P11831	508 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GNA12	Q03113	381 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	AHI1	Q8N157	1196 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CCNY	Q8ND76	341 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MNS1	Q8NEH6	495 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ACTL9	Q8TC94	416 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ASB2	Q96Q27	587 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SPON2	Q9BUD6	331 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	DEC1	Q9P2X7	70 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GGA2	Q9UJY4	613 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	HACD1	B0YJ81	288 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC188	H7C350	402 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MAP3K6	O95382	1288 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	APOD	P05090	189 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GJA4	P35212	333 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CSK	P41240	450 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	GBE1	Q04446	702 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	KDSR	Q06136	332 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	AP1B1	Q10567	949 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	LMAN2	Q12907	356 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CREG2	Q8IUH2	290 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	NPW	Q8N729	165 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	CEP112	Q8N8E3	955 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDB1-223	ENST00000543658	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.18	□□□□□ -0.46

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