RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM72BQ86X60 149 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 STK40Q8N2I9 435 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GANCQ8TET4 914 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SNX19Q92543 992 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MCEEQ96PE7 176 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 EDEM2Q9BV94 578 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 VPS45Q9NRW7 570 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 IFNKQ9P0W0 207 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SPTBN2O15020 2390 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 LAMA1P25391 3075 aa11.14□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A0D9SEW6 157 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 LNP1A1A4G5 178 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 E9PAM4 449 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 K7ERQ8 282 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 AP5Z1O43299 807 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ENDOD1O94919 500 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MOCS3O95396 460 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 RHOCP08134 193 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 RRM1P23921 792 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 CD6P30203 668 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SDC4P31431 198 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ACSL1P33121 698 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PSMD8P48556 350 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 UBASH3AP57075 661 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ARTNQ5T4W7 220 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 STPG1Q5TH74 334 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 LINGO4Q6UY18 593 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 DRC7Q8IY82 874 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF214Q8ND24 703 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 OR7D4Q8NG98 312 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ALG14Q96F25 216 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MUC3BQ9H195 1237 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 VPS28Q9UK41 221 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 C4orf47A7E2U8 309 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MEI4A8MW99 385 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MID1O15344 667 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 CCP110O43303 1012 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 LRP3O75074 770 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF217O75362 1048 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MT-CO1P00395 513 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GPD1P21695 349 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SCNN1AP37088 669 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 OGDHQ02218 1023 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 NETO2Q8NC67 525 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PSMB7Q99436 277 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SYT11Q9BT88 431 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 SPON2Q9BUD6 331 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM7Q9C029 511 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 RRN3Q9NYV6 651 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.13□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PP55 124 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 NPC1O15118 1278 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 F9P00740 461 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 CALB1P05937 261 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 CDH4P55283 916 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 HDAC4P56524 1084 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 TPM4P67936 248 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGAP8P85298 464 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
ANKRD42-209ENST00000533342 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms