RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527178.1

NDUFS3-205, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 269 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-205ENST00000527178 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 APOL6Q9BWW8 343 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PSME4Q14997 1843 aa8.36□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 M0QYV0 167 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CRTAMO95727 393 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SLC25A27O95847 323 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CFHP08603 1231 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RBP1P09455 135 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 IL10P22301 178 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 EDNRBP24530 442 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CYP2F1P24903 491 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PIK3R1P27986 724 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 HMOX2P30519 316 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 EPHB1P54762 984 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 AQP4P55087 323 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SLC25A3Q00325 362 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 DLG1Q12959 904 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PKDCCQ504Y2 493 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KRT80Q6KB66 452 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 C16orf46Q6P387 395 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RAPH1Q70E73 1250 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CHSY3Q70JA7 882 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TRIM50Q86XT4 487 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 FNDC8Q8TC99 324 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CALML6Q8TD86 181 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 BORCS5Q969J3 196 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 HPDLQ96IR7 371 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RDH12Q96NR8 316 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 HIPK3Q9H422 1215 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RHOJQ9H4E5 214 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PICK1Q9NRD5 415 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 PTPRJQ12913 1337 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TRIM64BA6NI03 449 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 E5RJQ4 531 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 H3BNH8 94 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TXNDC9O14530 226 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 TPP1O14773 563 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 DCXO43602 365 aa8.34□□□□□ -1.07
NDUFS3-205ENST00000527178 ITM2AO43736 263 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms