RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM44	O43615	452 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	STX6	O43752	255 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL3	O75679	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK4	P11802	303 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3M2	P53677	418 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN6	P56747	220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP2	Q13822	863 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF366	Q8N895	744 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PRORY	Q9H606	182 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRB	P23467	1997 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X0B3	334 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QKU1	62 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	EREG	O14944	169 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KLKB1	P03952	638 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD13	P35453	343 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSK	P43235	329 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CXADR	P78310	365 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CFHR1	Q03591	330 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE4B	O95155	1302 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX4	O00257	560 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN3	O60637	253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	C1S	P09871	688 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PDC	P20941	246 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX58	Q96C10	678 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY11	Q96G91	374 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KNL1	Q8NG31	2342 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	VILL	O15195	856 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6

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