RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 CSADQ9Y600 493 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WZ62 844 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 TMEM247A6NEH6 219 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 VTNP04004 478 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 OCM2P0CE71 109 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 STAG3L1P0CL83 205 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 CYP3A5P20815 502 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 HOXD12P35452 270 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 HALP42357 657 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 TMED10P49755 219 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 ESRRGP62508 458 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 CDO1Q16878 200 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PPM1LQ5SGD2 360 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 C16orf87Q6PH81 154 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 CXorf38Q8TB03 319 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 BCO2Q9BYV7 579 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 FBP2O00757 339 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 SERPINE1P05121 402 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PTPN7P35236 360 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 GMPRP36959 345 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 GJA8P48165 433 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 RXRGP48443 463 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 HSPA13P48723 471 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PHEXP78562 749 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 PPP2R5DQ14738 602 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 C12orf29Q8N999 325 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 KYQ8NBH2 561 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 COG4Q9H9E3 785 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 APOC2P02655 101 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 ZNF23P17027 643 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 RPL10P27635 214 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 UNC5BQ8IZJ1 945 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 ADAM32Q8TC27 787 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 MAF1Q9H063 256 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 EBF1Q9UH73 591 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 COQ6Q9Y2Z9 468 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-212ENST00000488380 HMX2A2RU54 273 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HSPA4LO95757 839 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RALBP11234 206 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 P4HA1P13674 534 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 L1CAMP32004 1257 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GSTM4Q03013 218 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TAP1Q03518 808 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ11Q14654 390 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DSELQ8IZU8 1212 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RTKNQ9BST9 563 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CEP350Q5VT06 3117 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GIPC1O14908 333 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CILPO75339 1184 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 H6PDO95479 791 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF24P17028 368 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GABRB2P47870 512 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 NDST2P52849 883 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CDH6P55285 790 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MS4A2Q01362 244 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ART3Q13508 389 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 NXNQ6DKJ4 435 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZFP1Q6P2D0 407 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 VPS50Q96JG6 964 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 LHX5Q9H2C1 402 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms