RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF580Q9UK33 172 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-210ENST00000485459 SOGA1O94964 1423 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-210ENST00000485459 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.69□□□□□ -1.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 DYNC1I1O14576 645 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-210ENST00000485459 CLGNO14967 610 aa4.68□□□□□ -1.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 PMPCAQ10713 525 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.665e-13■■■■■ 31.1
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RABGGTB-210ENST00000485459 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.68□□□□□ -1.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 MDGA2Q7Z553 956 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.65□□□□□ -1.67
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