RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 VPS28Q9UK41 221 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC72A6NJI9 287 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PAGE1O75459 146 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 DAB1O75553 588 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GFPT2O94808 682 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ENDOD1O94919 500 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ADCY5O95622 1261 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CD59P13987 128 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NOS2P35228 1153 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 DNA2P51530 1060 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 IRAK1P51617 712 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ATP11AP98196 1134 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NNTQ13423 1086 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ACAP1Q15027 740 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CST6Q15828 149 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CDO1Q16878 200 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KIF19Q2TAC6 998 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NAA35Q5VZE5 725 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC31Q6UY01 552 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 IGSF8Q969P0 613 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TTC17Q96AE7 1141 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 C18orf8Q96DM3 657 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MYOCQ99972 504 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SPON2Q9BUD6 331 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FBRSQ9HAH7 460 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SGK2Q9HBY8 427 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KLK13Q9UKR3 277 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CACNA1EQ15878 2313 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZZEF1O43149 2961 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KNL1Q8NG31 2342 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GVM2 712 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 RHOCP08134 193 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GLI1P08151 1106 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MMEP08473 750 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CYP11B1P15538 503 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CD27P26842 260 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KLK7P49862 253 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GALCP54803 685 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SHC2P98077 582 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB16Q05516 673 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KCNMA1Q12791 1236 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SYCP1Q15431 976 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MIIPQ5JXC2 388 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 LINGO4Q6UY18 593 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZVU0 165 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms