RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2-208ENST00000476817 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 OPHN1O60890 802 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 SEMA4FO95754 770 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 MBD3O95983 291 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 F9P00740 461 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 CHRNB2P17787 502 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 FLT3P36888 993 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 CDR2Q01850 454 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 DEUP1Q05D60 604 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 SULT2A1Q06520 285 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 NCAPHQ15003 741 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 SYCP1Q15431 976 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 TRNP1Q6NT89 227 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 PIP4P1Q86T03 277 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 PTPRN2Q92932 1015 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 FAM129BQ96TA1 746 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 SGK2Q9HBY8 427 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 SCML1Q9UN30 329 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP2-208ENST00000476817 NUMA1Q14980 2115 aa21.52■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 LGALS16A8MUM7 142 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CLDN11O75508 207 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF18P17022 549 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 FMO1Q01740 532 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 GRIK2Q13002 908 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CST6Q15828 149 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 USP30Q70CQ3 517 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.038e-6■■■□□ 15.6
CTBP2-208ENST00000476817 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 TMEM51Q9NW97 253 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 MID1O15344 667 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 GJB3O75712 270 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 NNMTP40261 264 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 STAT1P42224 750 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CDH4P55283 916 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ARCQ7LC44 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 BNIPLQ7Z465 357 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 STK40Q8N2I9 435 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 GANCQ8TET4 914 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SNX19Q92543 992 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SPAG5Q96R06 1193 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SLC32A1Q9H598 525 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CACNA1EQ15878 2313 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CNTN5O94779 1100 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CD59P13987 128 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 VAV1P15498 845 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 MMP8P22894 467 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SLC8A1P32418 973 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SHC2P98077 582 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 BNC1Q01954 994 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 UBXN1Q04323 297 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ALFQ53S48 1182 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 NEK11Q8NG66 645 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 FRS2Q8WU20 508 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 BIRC7Q96CA5 298 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 C1orf74Q96LT6 269 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.49■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 A0A1W2PP55 124 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 DRGXA6NNA5 263 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 TYRO3Q06418 890 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SLC14A1Q13336 389 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ARTNQ5T4W7 220 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 EMC1Q8N766 993 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.48■■□□□ 1.03
CTBP2-208ENST00000476817 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms