RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 GABRDO14764 452 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MTSS1O43312 755 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ATP9BO43861 1147 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCGP05129 697 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MYL4P12829 197 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PSEN2P49810 448 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ERFP50548 548 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 DAOAP59103 153 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SCAPQ12770 1279 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 RABGAP1LQ5R372 815 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM135Q86UB9 458 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 RSPH3Q86UC2 560 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 TNS4Q8IZW8 715 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 NEBLO76041 1014 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FYNP06241 537 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 IDH3AP50213 366 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 RABGGTBP53611 331 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM17P78536 824 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP157Q5JU67 520 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SENP8Q96LD8 212 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 AGAP2Q99490 1192 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 A6NHS1 94 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MYL3P08590 195 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM163BP0C2L3 166 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 USP17L7P0C7H9 530 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINB6P35237 376 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 GMPRP36959 345 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 HARS2P49590 506 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A3Q00325 362 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 IRGCQ6NXR0 463 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM35AQ86V20 835 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ISL2Q96A47 359 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SYT15Q9BQS2 421 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 GBA3Q9H227 469 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 A0A096LPK6 155 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 MPOP05164 745 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ANPEPP15144 967 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CPOXP36551 454 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 HCAR3P49019 387 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA3BQ13214 749 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MAVSQ7Z434 540 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 NPWQ8N729 165 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 AZIN2Q96A70 460 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC11Q96DB2 347 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MFSD3Q96ES6 412 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 KCNK16Q96T55 309 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 NDE1Q9NXR1 346 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MAGEB16A2A368 324 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 C9IYK1 514 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 HSPA4LO95757 839 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MAGEA12P43365 314 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 LHX1P48742 406 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 GJA9P57773 515 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 KCNMB4Q86W47 210 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM136AQ96C01 138 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PCED1BQ96HM7 432 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 TTC1Q99614 292 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 EPAS1Q99814 870 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SMOQ99835 787 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 WDCPQ9H6R7 721 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.71■□□□□ 0.59
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