RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	HHLA1	C9JL84	531 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118		M0QZ92	97 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	NRP1	O14786	923 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	MTSS1	O43312	755 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	F9	P00740	461 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TH	P07101	528 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PGAM1	P18669	254 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CCND1	P24385	295 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	NDUFV1	P49821	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	MGAT3	Q09327	533 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	GPR162	Q16538	588 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CST9	Q5W186	159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	EDEM1	Q92611	657 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	LGMN	Q99538	433 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	WDR91	A4D1P6	747 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	UGT1A9	O60656	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF623	O75123	536 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	RECK	O95980	971 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	LTF	P02788	710 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CYP11A1	P05108	521 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TIMP2	P16035	220 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CYP2B6	P20813	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	BGN	P21810	368 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PTPN4	P29074	926 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PCSK1	P29120	753 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	GRIA1	P42261	906 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CXCR3	P49682	368 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ARFIP2	P53365	341 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	INHBE	P58166	350 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	OCRL	Q01968	901 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	GJD3	Q8N144	294 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	CDKL2	Q92772	493 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP9-208	ENST00000463118	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53

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