RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460231.5

PCNP-202, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNP, Length 2,165 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-202ENST00000460231 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 PIAS1O75925 651 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 PEX11BO96011 259 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 SLC2A3P11169 496 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 PTPN3P26045 913 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 NR2C2P49116 596 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 HYAL1Q12794 435 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 CCDC25Q86WR0 208 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 AGAP3Q96P47 875 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 FMO2Q99518 471 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNP-202ENST00000460231 LEFTY2O00292 366 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 MAP2K7O14733 419 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 COG7P83436 770 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 OR7D4Q8NG98 312 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 AGPSO00116 658 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 GFRA2O00451 464 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PTPN2P17706 415 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SPARCL1Q14515 664 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 CAVIN3Q969G5 261 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SAMD11Q96NU1 681 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 UBP1Q9NZI7 540 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 WHRNQ9P202 907 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SHBGP04278 402 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PSMB4P28070 264 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 OR1E1P30953 314 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 XRCC4Q13426 336 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 RAB30Q15771 203 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ADGRF1Q5T601 910 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ELMOD1Q8N336 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PLD4Q96BZ4 506 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 HDAC11Q96DB2 347 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 FAM161BQ96MY7 647 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 F5H5T6 163 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 JCHAINP01591 159 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 RHOQP17081 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ITIH2P19823 946 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 BMP8BP34820 402 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 HSD17B3P37058 310 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PPP3CCP48454 512 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SLC7A9P82251 487 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ADGRE1Q14246 886 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 KCNJ11Q14654 390 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 PDK1Q15118 436 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ZNF534Q76KX8 674 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 MYLIPQ8WY64 445 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNP-202ENST00000460231 ZNF576Q9H609 170 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms