RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MAN1A1	P33908	653 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	GGCX	P38435	758 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ST8SIA6	P61647	398 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ECT2L	Q008S8	904 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PTPRN	Q16849	979 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	BOLA3	Q53S33	107 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ALF	Q53S48	1182 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TSSK4	Q6SA08	328 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf74	Q86VG3	221 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TEKT4	Q8WW24	435 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ALG14	Q96F25	216 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	HHIP	Q96QV1	700 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM7	Q9C029	511 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CD248	Q9HCU0	757 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SUN2	Q9UH99	717 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	USP18	Q9UMW8	372 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	NEU3	Q9UQ49	428 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	WASH4P	A8MWX3	477 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SRGAP2	O75044	1071 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RHOC	P08134	193 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	NNMT	P40261	264 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP25	P42331	645 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	IL12RB1	P42701	662 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	HCAR3	P49019	387 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	KRT83	P78385	493 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	NLRP14	Q86W24	1093 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RFFL	Q8WZ73	363 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ACOX2	Q99424	681 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	EPC1	Q9H2F5	836 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MPP6	Q9NZW5	540 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		15.03	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ANTXRL	A6NF34	631 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PROSC	O94903	275 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G5	P39877	138 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	FNTB	P49356	437 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	IRAK1	P51617	712 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	GSDMD	P57764	484 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SPA17	Q15506	151 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	APCDD1	Q8J025	514 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	GAB3	Q8WWW8	586 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MYO19	Q96H55	970 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MUC3B	Q9H195	1237 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEH1	Q9H213	219 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	VPS28	Q9UK41	221 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		15.02	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	NUP205	Q92621	2012 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM72C	H0Y354	149 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF217	O75362	1048 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PRKCH	P24723	683 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	EPHB2	P29323	1055 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	CLCN6	P51797	869 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC20A2	Q08357	652 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	DPYSL2	Q16555	572 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ANO7	Q6IWH7	933 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM72B	Q86X60	149 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		15.01	□□□□□ -0.01

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