RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 SYT15Q9BQS2 421 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 STMN3Q9NZ72 180 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 USP20Q9Y2K6 914 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TMX2Q9Y320 296 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TNFRSF10AO00220 468 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SNPHO15079 494 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MPOP05164 745 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ANPEPP15144 967 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TGM2P21980 687 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SERPINB5P36952 375 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TAF6P49848 677 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NCKAP1LP55160 1127 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GBE1Q04446 702 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CHRNB3Q05901 458 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 EPS8Q12929 822 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 Q3C1V9 767 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NOTUMQ6P988 496 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DTX3Q8N9I9 347 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SEMA4DQ92854 862 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 C19orf60Q96EN9 201 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CGRRF1Q99675 332 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SIK2Q9H0K1 926 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DIABLOQ9NR28 239 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 THAP1Q9NVV9 213 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 EMC3Q9P0I2 261 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 USP18Q9UMW8 372 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 H3BUI4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 FYNP06241 537 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 SOX6P35712 828 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 BST1Q10588 318 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ORC1Q13415 861 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RNF135Q8IUD6 432 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MICU2Q8IYU8 434 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 LZTS1Q9Y250 596 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 E9PBE3 544 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PRMT3O60678 531 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SERPINI2O75830 405 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ASMTLO95671 621 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PROCP04070 461 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CPB1P15086 417 aa6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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BDNF-211ENST00000439476 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SYTL3Q4VX76 610 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 LUZP2Q86TE4 346 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 OLFM1Q99784 485 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 A0A0J9YVX5 310 aa6.48□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.48□□□□□ -1.37
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