RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.1■■□□□ 1.13
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SH3BP5-204ENST00000412806 TEKT5Q96M29 485 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFAB1O14561 156 aa22.1■■□□□ 1.13
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SH3BP5-204ENST00000412806 CNTD1Q8N815 330 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3BP5-204ENST00000412806 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP5-204ENST00000412806 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-204ENST00000412806 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-204ENST00000412806 SMC6Q96SB8 1091 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-204ENST00000412806 YME1L1Q96TA2 773 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-204ENST00000412806 IL12RB2Q99665 862 aa22.06■■□□□ 1.12
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