RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C19orf54Q5BKX5 351 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NOMO2Q5JPE7 1267 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPIN3Q5JUX0 258 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLFN12LQ6IEE8 588 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCDC5Q6ZRR9 648 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OTOP1Q7RTM1 612 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OVCH1Q7RTY7 1134 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC47A2Q86VL8 602 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SFR1Q86XK3 245 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADGRF4Q8IZF3 695 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LSMEM2Q8N112 164 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYCT1Q8N699 235 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C7orf31Q8N865 590 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF114Q8NC26 417 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BVESQ8NE79 360 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HS6ST2Q96MM7 605 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RANBP9Q96S59 729 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNH7Q9NS40 1196 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MOCS1Q9NZB8 636 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB23Q9ULC3 237 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CACNA1AO00555 2505 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAMA5O15230 3695 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GSG1L2A8MUP6 293 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIASO43766 372 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UFL1O94874 794 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERVK-10P10266 1014 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCER1AP12319 257 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFI30P13284 250 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BCL3P20749 454 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC6A2P23975 617 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NRG3P56975 720 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPP30P78346 268 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPL24P83731 157 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC6A3Q01959 620 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPARDQ03181 441 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD69Q07108 199 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBE4AQ14139 1066 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNB1Q14721 858 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP3K11Q16584 847 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COL28A1Q2UY09 1125 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIM59Q8IWR1 403 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAS2Q8IYD9 372 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF786Q8N393 782 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC24A4Q8NFF2 622 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBF1Q8TES7 1133 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGSF8Q969P0 613 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C18orf15Q96N68 181 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRI1Q9BV20 369 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NIF3L1Q9GZT8 377 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUAK2Q9H093 628 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLAMF7Q9NQ25 335 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATAD3AQ9NVI7 634 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM86C1Q9NVL1 165 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF711Q9Y462 761 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DISP3Q9P2K9 1392 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAMB4A4D0S4 1761 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBBP9O75884 186 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKD3O94806 890 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNFRSF6BO95407 300 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VNN2O95498 520 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C22orf31O95567 290 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPHX1P07099 455 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCNP07585 359 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDHA1P08559 390 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAT2P11245 290 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNA6P17658 529 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS6KB1P23443 525 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 JAK1P23458 1154 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APLNRP35414 380 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIPAP38571 399 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ECT2LQ008S8 904 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BNC1Q01954 994 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLFN5Q08AF3 891 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAF1Q13077 416 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC14A1Q13336 389 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SP140Q13342 867 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTPROQ16827 1216 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa-1.66□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms