RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 P3H1Q32P28 736 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RUBCNQ92622 972 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 P2RY11Q96G91 374 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RAD54BQ9Y620 910 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RASA4BC9J798 803 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RNF103O00237 685 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RASA4O43374 803 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 MX2P20592 715 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 MCM3P25205 808 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 USP4Q13107 963 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 C5orf22Q49AR2 442 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAXCQ5TGI0 409 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 AFMIDQ63HM1 303 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 LZTR1Q8N653 840 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 SEC14L1Q92503 715 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD7Q92527 254 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 SNF8Q96H20 258 aa18.23■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RAMP2O60895 175 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 IVDP26440 423 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF8P28908 595 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ECHS1P30084 290 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 VIPR2P41587 438 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 PLTPP55058 493 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CDH4P55283 916 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CUL1Q13616 776 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ZNF77Q15935 545 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC24Q6UX98 284 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CARNMT1Q8N4J0 409 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 USP33Q8TEY7 942 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FGF13Q92913 245 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 HDAC11Q96DB2 347 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 PLK2Q9NYY3 685 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 MYO9BQ13459 2157 aa18.22■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GVM2 712 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 E2F8A0AVK6 867 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 NCAM2O15394 837 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM153BP0C7A2 387 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ACVRL1P37023 503 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 MAPKAPK2P49137 400 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CLCN6P51797 869 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ITGA8P53708 1063 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 BRD3Q15059 726 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM153CQ494X1 144 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 DDI1Q8WTU0 396 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RTP4Q96DX8 246 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 SOBPA7XYQ1 873 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CLDN11O75508 207 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 RHOCP08134 193 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 NDST2P52849 883 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 WASHC5Q12768 1159 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CALCOCO2Q13137 446 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 OR7D4Q8NG98 312 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CCHCR1Q8TD31 782 aa18.21■□□□□ 0.51
LTV1-201ENST00000367576 CDH23Q9H251 3354 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 DOCK4Q8N1I0 1966 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 A0A0D9SEW6 157 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GFRA2O00451 464 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TUBBP07437 444 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PTPN3P26045 913 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ACTN2P35609 894 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB17Q13105 803 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms