RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ZBED1O96006 694 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEA8P43361 318 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CLCN2P51788 898 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 AP2B1P63010 937 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 DEUP1Q05D60 604 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NME3Q13232 169 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MAP7Q14244 749 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ACAD11Q709F0 780 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMPRSS6Q8IU80 811 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 COLGALT2Q8IYK4 626 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ARMC5Q96C12 935 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ECSITQ9BQ95 431 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.11■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GVG6 124 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP69A5D8W1 941 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 KCNN4O15554 427 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NBNO60934 754 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 FKBP6O75344 327 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 LTFP02788 710 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GOT1P17174 413 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RBL1P28749 1068 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY1Q01534 308 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GBE1Q04446 702 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GAD2Q05329 585 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ITGA9Q13797 1035 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 FAM126BQ8IXS8 530 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF276Q8N554 614 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RTP4Q96DX8 246 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PIGVQ9NUD9 493 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D13Q9NVG8 400 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ATP9BO43861 1147 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CIB2O75838 187 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM63AO94886 807 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 AMPD1P23109 780 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PGM1P36871 562 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ARL4AP40617 200 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CDK18Q07002 472 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 GPNMBQ14956 572 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TBCCQ15814 346 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 AAGABQ6PD74 315 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CENPUQ71F23 418 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R14BQ96C90 147 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ANPEPP15144 967 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PHBP35232 272 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 OR1G1P47890 313 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 BFSP2Q13515 415 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RINLQ6ZS11 566 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 KBTBD2Q8IY47 623 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 C4orf33Q8N1A6 199 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 WDR60Q8WVS4 1066 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 IRGQQ8WZA9 623 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ETNK2Q9NVF9 386 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM161AQ9NX61 479 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NDE1Q9NXR1 346 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.09■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 MYCP01106 439 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NCAM1P13591 858 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TSHRP16473 764 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 NR2C2P49116 596 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 BASP1P80723 227 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB16Q05516 673 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 HIF1AQ16665 826 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PM20D1Q6GTS8 502 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RFWD2Q8NHY2 731 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 ADAM32Q8TC27 787 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 RNF139Q8WU17 664 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 PAK5Q9P286 719 aa19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SPNS1-204ENST00000352260 H3BRJ5 948 aa19.08■□□□□ 0.64
SPNS1-204ENST00000352260 ENPP3O14638 875 aa19.08■□□□□ 0.64
SPNS1-204ENST00000352260 KLF11O14901 512 aa19.08■□□□□ 0.64
SPNS1-204ENST00000352260 BANF1O75531 89 aa19.08■□□□□ 0.64
SPNS1-204ENST00000352260 COL6A1P12109 1028 aa19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms