RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341464.9

ZKSCAN3-202, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 1,794 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TPK1Q9H3S4 243 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 IP6K2Q9UHH9 426 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ERGIC3Q9Y282 383 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TMEM114B3SHH9 223 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 K7EPI3 171 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SNAP91O60641 907 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 IL18RAPO95256 599 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 VNN1O95497 513 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TNNC2P02585 160 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 GRK2P25098 689 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 NFKBIAP25963 317 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 DCKP27707 260 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 RXRGP48443 463 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SERPINB9P50453 376 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SLC5A3P53794 718 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ATP6V0D1P61421 351 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CUL2Q13617 745 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 GRIK4Q16099 956 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 KYAT1Q16773 422 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SEZ6Q53EL9 994 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 MORN1Q5T089 497 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 HPS6Q86YV9 775 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CTRCQ99895 268 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 C1orf50Q9BV19 199 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ACP6Q9NPH0 428 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PTPRJQ12913 1337 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 MCM3APO60318 1980 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SGK1O00141 431 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 MGEA5O60502 916 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TRPA1O75762 1119 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 GJB1P08034 283 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 MCF2P10911 925 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 COX4I1P13073 169 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TNFSF9P41273 254 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 WNT7BP56706 349 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CDC42EP1Q00587 391 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CAMK2BQ13554 666 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 KRT80Q6KB66 452 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CPT1BQ92523 772 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TOP1MTQ969P6 601 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.99□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.98□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 A0A087WZ62 844 aa8.98□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.98□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.98□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 CFAP99D6REC4 459 aa8.98□□□□□ -0.97
ZKSCAN3-202ENST00000341464 GPR25O00155 361 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms