RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PKNOX1P55347 436 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SNX16P57768 344 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 METTL7BQ6UX53 244 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TTC30AQ86WT1 665 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 RCN3Q96D15 328 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 C12orf42Q96LP6 360 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ASB7Q9H672 318 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SCN4AP35499 1836 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 A0A096LPK6 155 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 NEMP1O14524 444 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 HDAC3O15379 428 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CFLARO15519 480 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MPOP05164 745 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CEACAM7Q14002 265 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 STRA8Q7Z7C7 330 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF410Q86VK4 478 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM50Q86XT4 487 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 NIM1KQ8IY84 436 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PKP2Q99959 881 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CAPNS1P04632 268 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SETSIPP0DME0 302 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ME2P23368 584 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 EPHA3P29320 983 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CDKL1Q00532 357 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MS4A2Q01362 244 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PKDCCQ504Y2 493 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CLEC14AQ86T13 490 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 WDR41Q9HAD4 459 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PICK1Q9NRD5 415 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 GOT1P17174 413 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PTPRAP18433 802 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MPSTP25325 297 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PSMB4P28070 264 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PAOXQ6QHF9 649 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MAML3Q96JK9 1138 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 DOCK1Q14185 1865 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 LTFP02788 710 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CHRNGP07510 517 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 PCSK6P29122 969 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 SLC5A2P31639 672 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ARL4AP40617 200 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 HK2P52789 917 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 IRF9Q00978 393 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TNFAIP2Q03169 654 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CXCL9Q07325 125 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC185Q8N715 623 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 RNF148Q8N7C7 305 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 P2RY11Q96G91 374 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 CEP41Q9BYV8 373 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 OXSMQ9NWU1 459 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MID2Q9UJV3 735 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 A0A0J9YVX5 310 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 TRPA1O75762 1119 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 AMHP03971 560 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 IQCF3P0C7M6 154 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 MCF2P10911 925 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 RBP5P82980 135 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 ART3Q13508 389 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 HERC3Q15034 1050 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC25-201ENST00000339007 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms