RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CCDC14Q49A88 953 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZBED5Q49AG3 693 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SEZ6Q53EL9 994 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PPM1JQ5JR12 505 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 AFG1LQ8WV93 481 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 EME1Q96AY2 570 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RCN3Q96D15 328 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 MID2Q9UJV3 735 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GTW7 788 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CILPO75339 1184 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TRPA1O75762 1119 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 MPOP05164 745 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CD1EP15812 388 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RHDQ02161 417 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CAPSQ13938 189 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 DPYSL2Q16555 572 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RAB6CQ53S08 254 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GPR180Q86V85 440 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TTLL6Q8N841 843 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RDH11Q8TC12 318 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SLC35B4Q969S0 331 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 DOK1Q99704 481 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 DRC3Q9H069 523 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 MRGBPQ9NV56 204 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 OXSMQ9NWU1 459 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 A0A0A0MRY4 1105 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 HACD1B0YJ81 288 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TNNC2P02585 160 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ALDH2P05091 517 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 APOA4P06727 396 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 VDRP11473 427 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 P4HA1P13674 534 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ENTPD1P49961 510 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CSRP3P50461 194 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 NDST2P52849 883 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PKNOX1P55347 436 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 IL23RQ5VWK5 629 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TTC30AQ86WT1 665 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ITPKCQ96DU7 683 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 KLRG1Q96E93 195 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SPATA13Q96N96 652 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 RBBP8Q99708 897 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 HIPK3Q9H422 1215 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PALMDQ9NP74 551 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 SARDHQ9UL12 918 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 AP4S1Q9Y587 144 aa11.5□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WXM4 84 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 C9IYK1 514 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 M0QYV0 167 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 GRID2O43424 1007 aa11.49□□□□□ -0.57
GINS3-202ENST00000328514 CYP2F1P24903 491 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms