RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317147.9

CNOT1-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT1, Length 8,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1-201ENST00000317147 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 H0YAE9 185 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 KRT34O76011 436 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 SUPT7LO94864 414 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 UPP2O95045 317 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 EPN2O95208 641 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 APRTP07741 180 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 YES1P07947 543 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 CYP11B1P15538 503 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ITGAXP20702 1163 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CRHR1P34998 444 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PHKA2P46019 1235 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 C2CD6Q53TS8 623 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RNF145Q96MT1 663 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CPVLQ9H3G5 476 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TMEM94Q12767 1356 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 EML5Q05BV3 1969 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 EXTL3O43909 919 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 REM1O75628 298 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RBP3P10745 1247 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RALAP11233 206 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ALDH1B1P30837 517 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RORAP35398 523 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ELP6Q0PNE2 266 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 DCAF15Q66K64 600 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CHPFQ8IZ52 775 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 MIER2Q8N344 545 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 APPL2Q8NEU8 664 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ARMC1Q9NVT9 282 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 SLC2A3P11169 496 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 MSR1P21757 451 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PAX3P23760 479 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 AKAP5P24588 427 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 GSSP48637 474 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 USP46P62068 366 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PSMC6P62333 389 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ITGA7Q13683 1181 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 QPRTQ15274 297 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CDC73Q6P1J9 531 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 C11orf88Q6PI97 169 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 FAR1Q8WVX9 515 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 BBS2Q9BXC9 721 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 GMIPQ9P107 970 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PSME2Q9UL46 239 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 DCCP43146 1447 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 RNF103O00237 685 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 F9P00740 461 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 CD40LGP29965 261 aa4.59□□□□□ -1.67
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CNOT1-201ENST00000317147 SMIM11AP58511 58 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ITGADQ13349 1161 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 HYIQ5T013 277 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 FAXCQ5TGI0 409 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.59□□□□□ -1.67
CNOT1-201ENST00000317147 PDSS2Q86YH6 399 aa4.59□□□□□ -1.67
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